Tokko racconta che in un'epoca remota venne creata una scatola capace di donare l'immortalità a chi la apriva, peccato solo che nel momento della sua apertura venisse anche aperta la porta dimensionale dove vivono i demoni. Nel primo tentativo, vennero liberati 108 demoni i quali a loro volta vennero assorbiti e trasformati in 108 frammenti sparsi per la regione. Se mai venissero raccolti tutti, il portale si aprirebbe di nuovo provocando la distruzione della Terra. Un ragazzo di nome Ranmaru vive con la giovane sorella Saya. I due si sono trasferiti a Machida, una città vicina a Tokyo. Qui i genitori dei due vengono uccisi e il ragazzo giura di vendicarli. Ecco perché decide di iscriversi nella speciale truppa investigativa chiamata anche Tokko. Qua incontra una ragazza, membro ufficiale della divisione e sente per la prima volta delle storie secondo cui i membri di questa squadra non siano del tutto umani. Ranmaru comincia ad investigare e scopre che tutti i membri della seconda sezione Tokko hanno uno speciale tatuaggio che li identifica come parassiti di alcuni dei 108 demoni: grazie a questa loro caratteristica possono essere buoni o malvagi. Inoltre solo loro possono uccidere gli altri demoni, sfruttando la forza dei 108. Scopo della Tokko è distruggere tutti e 108 i demoni prima che il portale venga ricreato e aperto.